可可西里国家级自然保护区分布的哺乳动物有30种，鸟类54种，爬行类1种，鱼类6种。名录如下：
哺乳纲(MAMMALIA)
字串4
食肉目(CARNIVORA)
猫科(Felidae) 字串9
1、雪豹(Panthera uncia)
字串4
2、猞猁(Lynx lynx)
3、兔狲(Felis manul)犬科(Canidae)
4、狼(Canisl upus)
5、豺(Cuon alpinus) 字串8
6、赤狐(Vulpes vulpes) 字串4
7、藏狐(Vulpes ferrillata) 字串3
8、沙狐(Vulpes corsac)熊科(Ursidae)
9、棕熊(Ursus arctos)鼬科(Mustelidae)
字串1
10、石貂(Martes foina) 字串6
11、香鼬(Mustela altaica)
字串7
12、艾虎(Mustcla eversmanni) 字串4
13、狗獾(Meles meles) 字串5
奇蹄目(PERISSODACTYLA)马科(Equidae) 字串7
14、藏野驴(Equus kiang)
偶蹄目(ARTIODACTYLA)
字串9
牛科(Bovidae) 字串9
15、野牦牛(Poephagus mutus) 字串7
16、藏原羚(Procapra picticaudata) 字串9
17、盘羊(Ovis ammon) 字串7
18、岩羊(Pseudois nayaur)
字串3
19、藏羚(Pantholops hodgsoni)
字串2
鹿科(Cervidae)
20、白唇鹿(Cervus albirostris)
字串8
啮齿目(RODENTIA)
松鼠科(Seiuridae) 字串7
21、喜玛拉雅旱獭(Marmota himalayana)
仓鼠科(Cricetidae)
22、藏仓鼠(Cricetulus kamensis)
23、长尾仓鼠(Cricetulus longicaudatus)
田鼠科(Arvieolidae) 字串1
24、斯氏高山平(Altacola stoliczkanus) 字串1
25、白尾松田鼠(Pitymys leucurus) 字串9
跳鼠科(Dipodidae)
26、长耳跳鼠(Euchoretes naso)
兔形目(LAGOMORPHA)
字串5
鼠兔科(Ochotonidae) 字串1
27、黑唇鼠兔(Ochotona curzoniae)
28、柯氏鼠兔(Ochotona koslowi)
29、拉达克鼠兔(Ochotona ladacensis)兔科(Leporidae)
字串2
30、高原兔(Lepus oiostolus)
字串5
鸟纲(AVES)
字串4
鹳形目(CICONIFORMES) 字串3
鹭科(Ardeidae) 字串2
1、大白鹭(Egretta alba) 字串4
雁形目(ANSERIFORMES) 字串6
鸭科(Anatidae) 字串2
2、斑头雁(Anser indicus)
字串6
3、大天鹅(Cygnus cygnus) 字串6
4、赤麻鸭(Taborna ferruginea)
字串5
5、赤嘴潜鸭(Netta rufina) 字串5
隼形目(FALCONIFORMES)
鹰科(Accipitridae) 字串7
6、大鵟(Buteo hemiasius) 字串1
7、金雕(Aquila chrysaetos) 字串4
8、草原雕(Aquila rapax)
字串8
9、秃鹫(Aegypius monachus) 字串7
隼科(Faconidae) 字串5
10、猎隼(Faico cherrug J.E.Gray) 字串5
11、红隼(Falco tinnunculus)
鸡形目(GALLIFORMES)
雉科(Phasianidae) 字串8
12、藏雪鸡(Tetraogallus tibetanus) 字串6
鹤形目(GRUIFORMES) 字串5
鹤科(Gruidae) 字串3
13、黑颈鹤(Grus nigricollis) 字串9
鸻形目(CHARADRIIFORMES)
字串9
鸻科(Charadriidae) 字串9
14、斑鸻(Pluvialis dominca)
字串7
鹬科(Scolopacidae) 字串1
15、红脚鹬(Tringa totanus) 字串3
16、矶鹬(Tringa hypoleucos) 字串5
鸽形目(COLUMBIFORMES) 字串2
沙鸡科(Pteroclididae)
字串6
17、西藏毛腿沙鸡(Syrrhaptes tibetanus) 字串3
鸠鸽科(Columbidae) 字串4
18、岩鸽(Columba rupestris)
佛法僧目(CORACIIFORMES) 字串9
戴胜科(Upupidae)
字串8
19、戴胜(Upupaepops)
字串1
鸥形目(LARIFORMES) 字串5
鸥科(Laridae)
字串9
20、鱼鸥(Larus ichthyaetus) 字串4
21、棕头鸥(Larus brunnicephalus)
字串9
22、普通燕鸥(Sterna hirundo) 字串5
雀形目(PASSERIFORMES) 字串7
百灵科(Alaudidae) 字串6
23、长嘴百灵(Melanocorypha maxima)
24、短趾沙百灵(Calandrella cinerea) 字串7
25、细嘴沙百灵(Calandrella acutirostris)
26、角百灵(Eremophila alpestris) 字串1
27、小云雀(Alauda gulgula) 字串4
燕科(Hirundinidae) 字串9
28、灰沙燕(Roparia riparia) 字串6
29、岩燕(Ptyonoprpgne rupestris) 字串5
30、毛脚燕(Delichon urbica) 字串6
鹡鸰科(Motacillidae) 字串3
31、黄头鹡鸰(Motacoilla citreola)
32、白鹡鸰(Motacoilla alba)
33、平原鹨(Anthus campestris)
34、水鹨(Anthus spinoletta) 字串8
鸦科(Cervidae)
35、褐背拟地鸦(Pseudopodoces humilis) 字串8
36、红嘴山鸦(Pyrrhocorax pyrrhocorax) 字串4
37、渡鸦(Corvus corax)
伯劳科(Laniidae) 字串8
38、楔尾伯劳(Lanius tephronotus)
字串9
岩鹨科(Prunellidae) 字串3
39、棕胸岩鹨(Prunella strophiata) 字串5
40、褐岩鹨(Prunella fulvescens)
字串4
鶲科(Muscicapidae)
41、蓝点颏(Lusinia calliope) 字串8
42、赭红尾鸲(Phoenicurus ochruros)
43、漠即(Oenanthe isellini)
字串6
44、黑喉石即(Saxicola torquata) 字串5
45、棕背鸫(Turdus kessieri)
字串6
文鸟科(Ploceidae)
字串9
46、石雀(Petronia peteronia) 字串6
47、棕背雪雀(Montifrgilla blanfordi)
48、黑喉雪雀(Montifrgilla davidiana)
字串5
雀科(Fringillidae)
49、曙红朱雀(Carpodacus eos) 字串9
50、高山岭雀(Leucosticte nemoricola) 字串2
51、大朱雀(Carpodacus rubicilla) 字串5
52、拟大朱雀(Carpodacus rubicilleides) 字串6
53、红眉朱雀(Carpodacus pulcherrimus) 字串7
54、灰眉岩鹨(Emberiza cia) 字串2
爬行纲(REPTILIA)
字串4
蜥蜴目(LACERTIFORMES) 字串7
鬣蜥科(Agamimdae) 字串6
1、青海沙蜥(Phrynocephalus vliangalii) 字串2
鱼纲(PISCES)
字串3
鲤形目(CYPRINFORMES)
鲤科(Cyprinidae)
1、裸腹叶须鱼(Ptychobarbus kaznakovi)
字串1
2、小头裸裂尻鱼(Schizopygopsis microcephalus) 字串4
鳅科(Cobitidae)
3、长鳍高原鳅(Tripiophysa(T.)longianalis)
4、细尾高原鳅(Tripiophysa(t.)stenura) 字串1
5、细体高原鳅(Tripiophysa(T.)leptosoma) 字串9
6、小眼高原鳅(Tripiophysa(T.)microps)
字串2